تأسس إتحاد الجامعات العربية بموجب قرار رقم 2056 في 30 / 9 / 1964 من مجلس جامعة الدول العربية بناءاَ على توصية لجنة الشؤون الثقافية والإجتماعية، وفي عام 1965 أنشئت أمانة مؤقتة للإتحاد في القاهرة، وفي أيلول 1969 عقد أول إجتماع للمؤتمر العام للإتحاد حيث تحولت الأمانة المؤقتة إلى أمانة عامة دائمة وكان عدد الجامعات المؤسسة والعاملة (23) جامعة عربية. وفي عام 1984 نقل المقر العام للإتحاد إلى مدينة عمان في المملكة الأردنية الهاشمية.

الهدف الأساسي للإتحاد هو دعم الجامعات العربية في إعداد الإنسان القادر على خدمة أمته العربية وتحقيق تطلعاتها، وذلك بالعمل على أن تلتزم الجامعات العربية بالقيم النابعة من عقيدة الإسلام ورسالته الخالدة، وتطبيقها فكراَ وعملاَ لتحقيق هذا الهدف بجميع الوسائل المشروعة .

وافق مجلس إتحاد الجامعات العربية في دورته التي إنعقدت في جامعة بيروت العربية عام 1994 على توصية اللجنة التنفيذية لمجلس الإتحاد بتشجيع الجامعات على تأسيس إتحادات وجمعيات نوعية للكليات المتناظرة، والهدف من تأسيس هذه الإتحادات والجامعات هو توسيع نشاط إتحاد الجامعات العربية من خلال الكليات المتناظرة للعمل على تبادل اللقاءات بين أعضاء هيئة التدريس والطلبة، وإقامة الندوات والمؤتمرات لتطوير مناهجها الدراسية وإصدار المجلات العلمية المتخصصة وتبادل البحوث والدوريات والربط بين هذه الكليات المتناظرة بشبكات الإتصال.وتأسست حتى الآن (16) مجلة علمية.